Národní přírodní rezervace Boubínský prales byla rezervací vyhlášena roku 1858. Hlavní zásluhu na ochraně bukosmrkového lesa a člověkem nedotčené přírody měl lesmistr vimperských lesů schwarzenberského panství Josef John. Rezervace se od té doby rozrostla z 47 ha na současných 685 ha.
Boubínský prales je třetí nejstarší českou přírodní rezervací a jednou z nejvýznamnějších lesnických lokalit v Evropě.
